Science：肿瘤免疫治疗，基于菌群的精准医疗时代来临

　　Science[IF:37.205]

　　①临床前动物模型中，细菌可调节化疗及免疫疗法的抗癌效果，近期研究关注人体肠道菌群对抗癌药物的影响；②PD-1单抗对于肺癌、肾癌等上皮细胞肿瘤的疗效受肠道菌群影响，抗生素显著降低患者的平均生存期，Akk菌可能改善PD-1单抗的疗效；③PD-1单抗治疗黑色素瘤的效果与肠道菌群组成相关，柔嫩梭菌丰度较高的患者无进展生存期较长；④PD-1单抗治疗转移性黑色素瘤的效果与肠道菌群相关，长双歧杆菌、产气柯林斯菌和屎肠球菌的丰度影响疗效。

　　Precisionmedicineusingmicrobiota

　　2018-01-05DOI:10.1126/science.aar2946

　　Science：患者肠道菌群构成，显著影响抗PD-1疗法的效果！

　　Science[IF:37.205]

　　①用16S测序、宏基因组测序、定量PCR的综合方法，分析了42名转移性黑色素瘤患者的粪菌构成；②患者的菌群构成和抗PD-1免疫疗法的效果之间存在显著关联，在对疗法响应较好的患者菌群中，鉴定出长双歧杆菌、产气柯林斯菌和屎肠球菌等丰度较高；③给无菌小鼠移植这些患者的粪菌，可明显改善肿瘤控制、增强T细胞应答，获得更好的抗PD-1疗效；④菌群构成可影响癌症患者的抗肿瘤免疫，也可作为预测患者能否响应免疫检查点阻断疗法的生物标志物。

　　Thecommensalmicrobiomeisassociatedwithanti–PD-1efficacyinmetastaticmelanomapatients

　　2018-01-05DOI:10.1126/science.aao3290

　　Science：肠道菌给力，肿瘤免疫疗法实现PFS成倍增加！

　　Science[IF:37.205]

　　①分析112名接受抗PD-1免疫抑制剂治疗的黑色素瘤患者的口腔和肠道菌群，缓解（R）与非缓解（NR）组的肠道菌群显著不同；②平均无进展生存期（PFS）：R-232天，NR-188天；③对其中43名患者（30R，13NR），R患者的瘤胃菌科细菌的α多样性和相对丰度显著较高，肠道细菌的功能显著不同；④柔嫩梭菌（瘤胃菌科）丰度最高组，PFS达393天，拟杆菌丰度最高组，PFS仅188天；⑤R患者的全身和抗肿瘤免疫均增强，且将粪菌移植到无菌小鼠也确认类似情形。

　　Gutmicrobiomemodulatesresponsetoanti–PD-1immunotherapyinmelanomapatients

　　2017-11-02DOI:10.1126/science.aan4236

　　Science：抗PD-1抑制剂+肠道Akk菌↑，肿瘤生存期升84%！

　　Science[IF:37.205]

　　①分析249名患肺癌、肾癌等肿瘤并接受抗PD-1免疫抑制剂治疗的患者，69名同时接受广谱抗生素（ATB）；②ATB患者平均总生存期为8.3个月，远远低于非ATB患者的15.3个月；③患者体内Akkermansiamuciniphila（Akk菌）的相对丰度与对免疫检查点抑制剂（ICI）的响应显著相关；④将对ICI响应患者的粪菌移植给无菌小鼠，可以改善PD-1抑制剂对小鼠肿瘤的效果；⑤将对ICI不响应患者粪菌移植给无菌小鼠，后者口服Akk菌后，能恢复对PD-1抑制剂的响应。

　　GutmicrobiomeinfluencesefficacyofPD-1–basedimmunotherapyagainstepithelialtumors

　　2017-11-02DOI:10.1126/science.aan3706

　　Science：肠道中的ILC2可迁移至肺部，帮助宿主抵抗寄生虫

　　Science[IF:37.205]

　　①炎症性2型天然淋巴细胞（iILC2）可由IL-25或寄生虫诱导产生，为循环细胞，来源于肠道固有层中的静息态ILC2；②ILC2的迁移依赖于1-磷酸鞘氨醇（S1P）介导的趋化反应，后者促进ILC2进入淋巴管，并通过血液循环在积累于外周组织（包括肺部）中；③由肠道进入肺部的iILC2与在肺部定居的nILC2不同，iILC2可促进抗寄生虫防御及组织修复；④ILC2的扩增与迁移与抗原引起的适应性免疫反应中的淋巴细胞增殖与迁移相似，提示ILC是适应性免疫的补充。

　　S1P-dependentinterorgantraffickingofgroup2innatelymphoidcellssupportshostdefense

　　2018-01-05DOI:10.1126/science.aam5809

　　Science：肺炎可能起源于肠道？

　　Science[IF:37.205]

　　①天然淋巴细胞（ILC），参与机体的稳态和哮喘等病理过程；②Huang等证实，IL-25诱导ILC2从肠道迁移至肺部，即通过ILC2的肠-肺募集轴参与“2型免疫”；③炎症性（iILC2）通过淋巴系统循环入血，可通过淋巴-上皮屏障；④iILC2和nILC2在肺内发挥不同的作用，iILC2由肠道募集于肺参与快速和一过性2型免疫，而nILC2主要常驻于组织，对病毒感染进行应答；⑤1-磷酸鞘氨醇（S1P）受体S1P1抑制剂ozanimod可用于慢性炎症性肺疾病，如哮喘、COPD等。

　　Lunginflammationoriginatinginthegut

　　2018-01-05DOI:10.1126/science.aar4301

　　FI：肠道菌群产生的丙酸或在自闭症中有潜在作用

　　FrontiersinImmunology[IF:6.429]

　　①自闭症患者的淋巴母细胞系（LCL）存在线粒体功能障碍（AD-A）和正常（AD-N）两个类群；②丙酸对健康人LCL及患者的AD-N型LCL的免疫基因表达影响甚微；③丙酸可显著激活自闭症患者的AD-A型LCL的免疫相关基因，更多类型和数量的免疫相关基因的表达发生改变，特别是人白细胞抗原和免疫球蛋白的表达显著上调；④尽管细胞实验有剂量效应、组织特异性等问题，该结果提示肠道菌代谢产物可激活代谢异常的LCL的非典型免疫反应。

　　Modulationofimmunologicalpathwaysinlymphoblastoidcelllinesbytheentericmicrobiomemetabolitepropionicacid

　　2017-12-22DOI:10.3389/fimmu.2017.01670

　　CR：免疫因素通过影响病原体以改变宿主的菌群组成

　　CellReports[IF:8.282]

　　①分析环境因素在适应性免疫缺陷小鼠（Rag2-/-）和Nlrp6缺陷小鼠（一种参与调节菌群组成的免疫传感器）中对菌群形成的影响；②在常规饲养的Nlrp6-/-小鼠中，家族性传播对菌群组成有显著影响；③SPF条件下，野生型、Nlrp6-/-和Rag2-/-小鼠有相似的菌群；④宿主免疫对菌群的影响可通过引入病原体来检测，基因型、环境因素和生态因素共同影响菌群定殖；⑤Nlrp6以及适应性免疫对菌群组成的影响依赖于群落结构，且主要影响病原体而非共生菌群。

　　ShapingofIntestinalMicrobiotainNlrp6-andRag2-DeficientMiceDependsonCommunityStructure

　　2017-12-26DOI:10.1016/j.celrep.2017.12.027

　　Microbiome：饲料中添加丁酸钠改善鱼类的肠道菌群及抗病能力

　　Microbiome[IF:8.496]

　　①低（0.8%）植物饲料添加饲养的真骨鱼，在细菌感染后可幸存下来；②而高植物饲料添加可增加寄生虫感染水平，降低生长状况和肠道菌群多样性，诱导发光细菌属占优势菌，改变肠道黏膜蛋白质组成并影响肠道功能；③在高植物饲料中添加0.4%丁酸钠，可稍微降低真骨鱼细菌感染后的累积死亡率，避免寄生虫寄生后的生长迟缓现象，肠道菌群多样性和产丁酸菌增加，并逆转植物饲料引起的肠道蛋白质组成的变化；④结果可为鱼类饲料添加方案提供参考。

　　Undercontrol:howadietaryadditivecanrestorethegutmicrobiomeandproteomicprofile,andimprovediseaseresilienceinamarineteleosteanfishfedvegetablediets

　　2017-12-28DOI:10.1186/s40168-017-0390-3

　　Nature子刊：多种方法助菌群因果性研究

　　NatureMicrobiology[IF:N/A]

　　①高通量方法可分析肠道菌群与宿主生理和疾病的相关性，但仍需其它方法来明确机制；②Surana等采用菌群-表型三角剖分的新方法鉴定因果性微生物；③已开发交叉菌群培养、生物信息学等方法鉴定导致特定表型的功能性微生物、分析控制关键过程的代谢产物；④很多表型可能涉及多种菌的共同作用，目前尚无充分有效的培养方法和筛选微生物组合的能力；⑤将来可进行功能缺失性实验，选择性清除微生物或抑制其产物，有助于鉴定引起特定表型的微生物。

　　Assigningfunctiontosymbionts

　　2018-01-01DOI:10.1038/s41564-017-0088-0

　　Nature：新方法，促进菌群研究从相关到因果！

　　Nature[IF:40.137]

　　①在结肠炎小鼠模型中定殖不同菌群，生存状况各异，共饲养让菌群有交流，小鼠展现出结肠炎中度敏感性；②利用“微生物-表型三角剖分法”，发现毛螺菌科可防止疾病，通过定向微生物培养技术，明确Clostridiumimmunis阻止结肠炎倾向性小鼠死亡；③该方法具有普适性，利用它成功鉴定几种诱导一种肠道抗菌肽表达的共生菌；④对完全不同的表型，该方法将相关性微生物组分析“升格”为因果性微生物鉴定，预计可在人类微生物组研究中被广泛应用。

　　Movingbeyondmicrobiome-wideassociationstocausalmicrobeidentification

　　2017-12-06DOI:10.1038/nature25019